CONCORSO (scad. 4 ottobre 2011) - Bando Scuola di dottorato di ricerca in scienze biomolecolari - 27° ciclo

IL RETTORE Vista la legge del 3 luglio 1998, n. 210 e in particolare l'art.

4, che demanda alle universita' il compito di disciplinare con proprio regolamento l'istituzione dei corsi di dottorato di ricerca, le modalita' di accesso e di conseguimento del titolo, nel rispetto dei criteri generali fissati con regolamento ministeriale;

Visto il decreto ministeriale del 30 aprile 1999, n. 224, recante i criteri generali cui debbono attenersi le singole sedi universitarie nel disciplinare i corsi di dottorato di ricerca;

Visto il decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri del 9 aprile 2001 e successive modificazioni e integrazioni, con il quale sono stati determinati i criteri per l'uniformita' di trattamento sul diritto agli studi universitari;

Visto lo statuto dell'Universita' degli studi di Trento e in particolare l'art. 12, comma 9;

Visto il regolamento di ateneo in materia di scuole di dottorato di ricerca, emanato con decreto rettorale del 16 dicembre 2003, n.

997 e successivamente modificato con decreto rettorale del 19 aprile 2006, n. 359;

Vista la proposta del Centro interdipartimentale di biologia integrata (CIBIO);

Vista la relazione del Nucleo di valutazione interna di data 29 dicembre 2009 in ordine ai requisiti di idoneita' delle scuole di dottorato di ricerca proposte;

Vista la delibera assunta congiuntamente dal senato accademico e dalla commissione della ricerca scientifica del 12 gennaio 2011;

Tutto cio' premesso;

Decreta:

Art. 1

Attivazione E' attivato presso l'Universita' degli studi di Trento il 27° ciclo della scuola di dottorato di ricerca in scienze biomolecolari.

E' indetta selezione pubblica per la copertura di dodici posti di cui nove coperti da borsa di studio.

Le borse di studio sono finanziate come di seguito:

tre borse di studio - finanziate dall'Universita' degli studi di Trento.

Attivita' di ricerca da svolgersi presso i laboratori del CIBIO Centre for Integrative Biology.

Per maggiori informazioni sui laboratori visitare il sito:

http://www.unitn.it/en/cibio/11875/laboratories;

una borsa di studio - finanziata dal CIBIO - Centre for Integrative Biology (presso l'Universita' degli studi di Trento) finalizzata alla sequente tematica di ricerca: 'p53-directed post-transcriptional translational control of gene expression:

decoding the translatome within the p53 response network'.

Referente: prof. Alberto Inga.

Per maggiori informazioni sul laboratorio visitare il sito:

http://www.unitn.it/en/cibio/11884/laboratory-transcriptional-network s;

una borsa di studio - finanziata dalla Fondazione Bruno Kessler (FBK), finalizzata alla seguente tematica di ricerca: 'Development of microdevices for 3D cell micro-culture and for purification and analysis of nucleic acids, i.e. materials and structures aimed at the isolation of miRNA, small RNA and mutated DNA from cell fluids deriving 3D cell cultures'.

Il progetto sara' svolto presso l'unita' di 'Superfici e interfacce Biofunzionali' del Centro Materiali e Microsistemi presso FBK. L'unita' lavora principalmente sulla funzionalizzazione di superfici per applicazioni biologiche. La ricerca si focalizzera' sullo sviluppo di superfici funzionali per l'inserimento in micro-dispositivi con l'obiettivo di rilevare ed isolare piccoli RNA, quali i microRNA. Attraverso una collaborazione con gli ospedali, si studiera' l'utilizzo dei microRNA come nuovi biomarcatori circolanti per la diagnostica del cancro.

Referente: dott. Cecilia Pederzolli.

Per maggiori informazioni sul laboratorio visitare il sito:

http://mpba.fbk.eu.

Borse vincolate per l'assegnazione della quale e' richiesta una specifica idoneita' valutata in sede di prova orale:

una borsa di studio - finanziata da The Microsoft Research University of Trento Centre for Computational and Systems Biology (COSBI), vincolata alla tematica di ricerca: 'Mechanistic modeling of genetic and signaling networks connecting diet and diseases relying on mouse models of human disease'.

The candidate is expected to build an algorithmic model (see http://www.cosbi.eu/index.php/research/alg-sys-bio) of the folate cycle or other mechanisms that are related to obesity, relying on experimental data. The design and realization of the model will be done at COSBI within the molecular nutrition activities (see http://www.cosbi.eu/index.php/research/molecular-nutrition). The candidate is expected to perform his/her experimental work at ISB (Institute for Systems Biology) - Seattle in Nadeau's Lab (see http://www.systemsbiology.org/scientists_and_research/faculty_groups/ Nadeau_Group). A master in bioinformatics or bioengineering with knowledge of programming and data manipulation procedures is requested.

Per maggiori informazioni sul laboratorio visitare il sito:

http://www.cosbi.eu/index.php/people/careers.

Referente: dott. Attila Csikasz-Nagy;

una borsa di studio - finanziata da The Microsoft Research University of Trento Centre for Computational and Systems Biology (COSBI), vincolata alla tematica di ricerca: 'Modeling of human disease from multi-source data for supporting P4 medicine'.

The candidate is expected to build an algorithmic model (see http://www.cosbi.eu/index.php/research/alg-sys-bio) of a human disease (it could be either heart disease or a neuro-degenerative disease), relying on experimental data. The design and realization of the model will be done at COSBI (see http://www.cosbi.eu). The candidate is expected to perform his/her experimental work at ISB (Institute for Systems Biology) - Seattle in Hood's Lab (see http://www.systemsbiology.org/scientists_and_research/faculty_groups/ Hood_Group/Profile). A master in bioinformatics or bioengineering with knowledge of programming and data manipulation procedures is requested.

Referente: dott. Attila Csikasz-Nagy;

una borsa di studio - The Microsoft Research - University of Trento Centre for Computational and Systems Biology (COSBI), vincolata alla tematica di ricerca: 'Understanding the molecular details of microtubule dynamical instability by computational modeling'. The candidate is expected to build an algorithmic model (see http://www.cosbi.eu/index.php/research/alg-sys-bio) of the molecular events that cause dynamical instability. Our software tool will be used to fit experimental data. A master's degree in bioinformatics, bioengineering or biophysics with basic knowledge of programming a mathematics is requested.

Referente: dott. Attila Csikasz-Nagy;

una borsa di studio - Fondazione Bruno Kessler (FBK), vincolata alla tematica 'Computational Functional Genomics', per l'assegnazione della quale e' richiesta una specifica idoneita' valutata in sede di prova orale. Il candidato ideale dovra' avere un forte interesse a sviluppare una competenza interdisciplinare nei metodi computazionali per la genomica funzionale ad alta processivita', con particolare attenzione al sequenziamento di nuova generazione. Si richiedono conoscenze di base dei meccanismi di regolazione a carico del DNA,

RNA (miRNA) e delle proteine. Sono richieste conoscenze informatiche intermedie o superiori, dei linguaggi di programmazione (Python e C a livello di base), competenza nell'uso dei sistemi * nix OS, capacita' di utlizzare le banche dati e gli strumenti standard di bioinformatica. La competenza matematica di base dovrebbe includere l'algebra lineare. Sono anche richieste delle basi di statistica.

Sara' data la preferenza a un candidato con un Master (Laurea magistrale/specialistica o equivalente) in matematica, biotecnologie, bioinformatica o bioingegneria.

Referente: dott. Cesare Furlanello.

Per maggiori informazioni sul laboratorio visitare il sito:

http://mpba.fbk.eu.

Durata del programma: triennale.

Lingua ufficiale del corso: inglese.

Coordinatore: prof. Paolo Macchi - tel. +39 0461 283819-3095 e-mail: phd.bioscie@unitn.it.

Settori scientifico-disciplinari:

BIO/06 - Anatomia comparata e citologia;

BIO/10 - Biochimica;

BIO/11 - Biologia molecolare;

BIO/12 - Biochimica clinica e biologia molecolare clinica;

BIO/13 - Biologia applicata;

BIO/18 - Genetica;

BIO/19 - Microbiologia;

CHIM/06 - Chimica organica;

INF/01 - Informatica.

Aree di ricerca:

1) Biochimica;

2) Bioinformatica;

3) Biologia computazionale;

4) Biologia dei sistemi;

5) Biologia dello sviluppo;

6) Biologia molecolare e cellulare;

7) Biologia sintetica;

8) Biologia strutturale;

9) Chimica organica;

10) Genetica;

11) Genomica microbica;

12) Lipidomica e biomembrane;

13) Metabolomica e imaging metabolico;

14) Nanobiotecnologie;

15) Neurobiologia;

16) Vaccinologia molecolare;

17) Virologia molecolare.

Nota - I posti con borsa di studio potranno essere aumentati a seguito di finanziamenti, erogati da altre universita', enti pubblici di ricerca o da qualificate strutture produttive private, che si rendessero disponibili dopo l'emanazione del presente bando e prima della valutazione dei titoli. L'eventuale aumento del numero di borse di studio potra' determinare l'incremento dei posti complessivamente messi a concorso.

I candidati che intendessero ottenere l'idoneita' anche per le eventuali borse aggiuntive a tematica vincolata, dovranno farne esplicita richiesta alla commissione esaminatrice al momento dell'identificazione per lo svolgimento del colloquio, al fine di permettere alla stessa di valutare la specifica idoneita'.

Di tale incremento sara' data comunicazione soltanto alla pagina internet: http://www.unitn.it/ateneo/2548/concorso-di-ammissione.

Art. 2

Requisiti di ammissione Possono presentare domanda di partecipazione al concorso di ammissione alla scuola di dottorato di ricerca di cui al precedente articolo, senza limiti di sesso, di eta' e di cittadinanza, coloro che sono in possesso di laurea specialistica (magistrale), attivata ai sensi del decreto ministeriale n. 509 del 3 novembre 1999...